現代的中醫由於遭受文化大革命、中西醫結合等劫難，精華部分已經大量遺失，所繼承下來的只不過是一些湯頭、處方，治病的方法也大量結合了西醫的東西，也講什麼化驗結果、成份等等，完全失去了中醫治病的東西。
中國神傳文化中中醫是非常典型的一門學科。古代中醫不僅體現了古代天人合一的科學思想觀，其治病方法的發達也遠遠超出現代的科學。從中醫的處方上，我們可以領略到古代中醫大夫的思維方式的科學性。
古代中醫學把人看作一個整體，看作一個小宇宙，講究陰陽平衡，調理治療的方法也完全是建立在陰陽五行、五運六氣、臟腑經絡、氣血運行的基礎之上的。就處方而言，藥的配伍是講究君臣佐使的。處方也不是我們今天認識的白紙黑字那麼簡單。曾有人拿西醫的理論，用物質成份、含量來試圖分析中醫治療的療效，這是得不出正確結論的。中醫治病的奇效是事實，因為這是不同的理論體系和方法，用現代科學的理論去分析是根本不對路的。
打個比方，中醫對人體的認識是整個人的陰陽、氣血、經絡運行，包括人的行為、思想、精神、環境等等因素，而西醫則看的是人體水份、蛋白、細菌、病毒等等，相比之下，西醫失去了人體的精神、思想等作為生命的根本要素。
古代的中醫大夫大都是修養有素的，但今天的人由於受現代科學觀念的影響，對中醫的一些治病方法，視為迷信，加之有些方法也不是現代人所能認知的。比如：祝由十三科，裡面有畫符燒香等一些獨特的方法。而中醫的處方，古代中醫在診斷後，開具的處方是很有講究的。
舉個典型的例子：中醫把人體看作是一個小宇宙，人體那裡有瘤子，發炎等，認為是氣血不通引起的。治療的方法，也有多種，處方下藥的原理就和排兵佈陣打仗一樣，講究君臣佐使，君為主，臣、佐為輔助，使為引子，這支軍隊準備去疏通氣血，使病人恢復健康。
當然這篇文章目地不是探討中醫理論、治療方法，而是為了說明中醫治病的思維方式，舉的典型例子也是概括的講。根本用意是為了瞭解古代正統神傳文化的思維方式和對世界的看法，破除現代科學的禁錮，說明不能用現代科學和黨文化的東西去理解、分析中華五千年文明神傳文化的精粹。
中華五千年文明是神傳給人的，是正常人類社會應有的文化，瞭解古代中醫理論知識，是為了破除黨文化的毒害。回歸人類正統文化，就要轉變今天的科學和黨文化強加給人的思維方式以及觀念，在中國五千年神傳文化文明中尋找正確答案。
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