明朝憲宗成化五年（公元１４６９年），文選郎中陳雲等人，被屬吏揭發，都被罷官入獄。吏部尚書深知黃孔昭廉潔，把他調到文選司，九年提升為郎中。按照慣例，文選郎中是朝廷選拔人才的主要負責人，大多閉門謝客。
黃孔昭不同意這種做法，說：「國家選用人才，好比富足人家蓄積糧食。糧食如果不平常蓄積，饑荒時怎麼能夠接濟百姓?人才不預先儲備，用人時怎麼能滿足需要呢?如果閉門謝客，又從哪裡瞭解發現天下的人才俊傑呢？」所以，平時由官府回到家中，遇有來客，黃孔昭都以禮相待，並留意尋訪人才，隨時記住。在除授官職時，依據才能的高下，分別派往難於治理的地方和容易治理的地方任職。因此選拔任用，做得公平合理。如果有人以私利求請，他都予以拒絕。
有一次，黃孔昭與他的上級吏部尚書尹曼爭論，惹得尹曼大怒，順手推翻了桌子。黃孔昭垂手站立，等他息怒了，接著又陳述自己的觀點。尹曼也相信黃孔昭誠信正直。尹曼和通政使談倫（人名）關係親密，想任用他為吏部侍郎，黃孔昭堅持認為不可以。尹曼還是用了談倫，後來談倫果然垮臺。證實了黃孔昭的知人之明。
尹曼想推薦老朋友擔任巡撫，黃孔昭不同意。這個人進京拜謁黃孔昭，直至雙膝跪下求情。黃孔昭更加鄙視他。尹曼命令推舉，黃孔昭說：「他所缺少的，正是大臣的體統。」尹曼只好對這個人說：「黃孔昭不離開選曹，在他執掌文選郎中期間，你是得不到陞遷的了。」
黃孔昭扭任文選郎中滿了九年時間，才升為右通政。又過了好久，調任南京工部右侍郎。當時，有十多處官地，被權門大戶侵佔，黃孔昭奏請皇帝，全部收回了這些官地。在奉詔命薦舉大臣時，黃孔昭薦舉了知府樊瑩、僉事章懋，這兩人後來都成為名臣，為百姓做了許多好事。
主管銀庫的郎官，把幾千兩盈餘的銀子，進奉給黃孔昭，結果被黃孔昭呵斥而退。
有人挖地時，挖出了一隻古鼎，黃孔昭馬上命工匠刻上「文廟」二字，把古鼎送到文廟中。不多久，宦官權貴，想把古鼎進獻朝廷，看見古鼎刻有「文廟」二字，才不好那麼做了。
正是：
一旦掌權時，
便把德政施。
為國為民志不移，
堅定如鐵石！
這樣的好官古多有，
今人往往笑其癡。
癡乎？不癡，是大智；
人知，地知，天更知！
（事據《明史‧黃孔昭傳》）
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