自閉兒的行為問題依其性質可分為攻擊行為，不適當的行為，自我刺激的行為，同一性的行為、怪異行為等。
一、攻擊行為﹙自傷、傷人﹚︰
（一）、行為型態：
自閉兒童常會撞牆、搥頭、拍耳朵、撞桌子等自傷行為；自閉兒也常常有傷人（踢、咬、捏、抓、打）的攻擊行為。
（二）、原因（不愉快情緒的表達）：
一般而言，自閉兒的攻擊行為大都來自於憤怒或恐懼的情緒，例如當自閉兒從事某一活動被中止，或某種要求不遂所願，或生活環境被改變，或被要求去做他不要做的事等等，他可能做出攻擊自己或攻擊他人〈如咬人、打人等〉行為。基本上，他是以攻擊別人優先，若不敢攻擊別人，或攻擊不了他人，便傷害自己。茲分述如下：
1、抗議：當自閉兒從事某一活動被中止（如在沙推玩沙子，或在沙發上跳來跳去）；生活習慣被改變，如在學校或家裡座位被調換，奶瓶或牙刷被更換；自我刺激行為受到阻撓；被要求去做一件他所不要做的事。
2、生氣：某種要求不遂所願（想打開冰箱拿麵包吃，卻被阻止），或大人不瞭解其欲求（沒有口語能力的自閉兒）；或生活環境被改變（如傢具更換位置）；生活習慣的改變（如原來在牆角尿尿被要求到馬桶尿尿）。
3、反抗：被要求去做他不要做的事。
4、對恐懼的反應：自閉兒常會有異常的恐懼，如社會性恐懼（自閉兼低智能者常會害怕陌生人或陌生的環境）；感覺便亦造成的恐懼，如有一自閉兒害怕怪手的敲擊聲，不停地咬、捏、抓傷爸爸。）
（三）、處理策略：
透過功能性評量（或稱為行為的功能性分析）以瞭解其行為的功能性目的， 然後教導以合適的行為（功能性等值的行為）以替代不合宜的行為。
有些自閉兒會有撞頭的行為，若此行為發生在生氣的時候，則是抗議的行為。處裡的方法是教導他說：「我不要」「我不喜歡」「我生氣了」，如果不會說話可以教導替代性的行為表達。前面有關語言表達一節已經略加敘述了。
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