【大纪元2021年07月27日讯】（大纪元记者李撷璎台湾嘉义综合报导）中共病毒（俗称新型冠状病毒）疫情延烧一年多来，大家都对基因定序不陌生，透过解码和比对，能从中找出病例的关系是否来自同一批感染源。中正大学资讯工程系教授黄耀廷长年研究感染微生物基因定序，看见医院临床追踪不明感染原因的困境，近期着手建置“台湾病原体在地资料库”，可望让台湾面对下一波传染疾病时，能加快辨识感染病原。
病原追踪有多重要，除了分析致病、致死的病原体，还可找出相近的群聚，以及辨识新出现的变异。中正资工系教授黄耀廷说：“要知道是什么病原体感染的，必须判读基因序列，但背后一定要有庞大的微生物资料库。”这次台湾中共病毒疫情中，病人染疫后常因免疫力下降而被其它病原体再侵入，不仅增加治疗困难度，且还有难以判断感染源的个案，突显台湾基因定序技术虽能一次完整扫描上亿个基因碎片，但最缺少的还是一个全面性的在地资料库。
事实上，临床也常发生急重症病人出现不明原因发烧、肺炎等症状，医师无法第一时间确认病原体，只能根据经验判断或使用传统病原体培养技术，而错失治疗的黄金时机。黄耀廷表示，过去台湾微生物基因定序大多局限在如大肠杆菌、沙门氏菌等常见菌种，当遇到新亚种或罕见菌时，光是正确鉴定就有困难，即便鉴定出来，医师依然仰赖欧美国家常见抗药性的统计资料用药。
然而，所有病原体都有在地化的倾向。“每个国家从水土环境、食物、抗生素使用不同，就会孕育出特有的病原体。”黄耀廷六年前与台中荣总感染科医师合作抗药菌株研究，就发现台湾有些病原体的基因序列和国外长得不太一样，甚至发展出在地抗药性的突变菌株，参考欧美资料治疗的效果自然打折，于是让他决定动手建立在地资料库。
黄耀廷长年研究主力放在感染微生物基因定序及分析软体开发，近期更与亚洲准译公司产学合作，建置“台湾病原体在地资料库”。黄耀廷最近先从台湾医院常见感染微生物基因体开始，如克雷伯氏肺炎链球菌、结核分支杆菌等下手，并透过与全台各大医学中心临床试验逐步扩充。
黄耀廷说：“微生物包含细菌、真菌、病毒，光是病毒株序列就有二百多万条，资料量庞大繁杂，处理过程不只需要同时具备软体和微生物专业知识，还得全盘了解感染科医师判读与治疗准则。”
该资料库预计一年后完成，提供医院发展精准医疗的一个新选择。黄耀廷表示，不仅将帮助医师即时找出重症或危险族群感染的病原体，也能追踪台湾特有的抗药基因，让投药更加精准，甚至当出现新兴疾病时，用来比对相似的基因和可能的来源，以及预防疫情扩散。
责任编辑：黄善
