然而，中立还不如麦克亚瑟创建军队的想法现实。这个弱小，贫穷的国家位置不佳，刚好在日本黑天神南下的路上，中立的幻想是对这一问题的逃避。日本并不想要一个菲律宾。他们觑觎的是东南亚的矿产——马来西亚的橡胶、婆罗洲的石油、以及难以捉摸的命运之神赋予其他国家的锡、珠宝和黄金。菲律宾正好位于日本和其目标之间的航线上。
为了保障这条航线，日本陆军必须占领菲律宾群岛。菲律宾的地理位置是它的不幸，而不是幸运。保卫群岛的问题，就像解决著名的欧洲军事难题，保卫夹在德俄之间的波兰一样，没有更好的办法。
墨菲和麦克亚瑟之间的真正区别在于，一个认为，如果日本人想要占领菲律宾，必须让其付出代价，而另一个眼界颇高的绥靖主义者却不这么认为。而对解决这一问题负有责任的总统决定召回麦克亚瑟。罗斯福大概觉得菲律宾不值得防守。他是前海军副部长，迷信海空军，不相信陆军。陆军部甚至在珍珠港事件后还发现，罗斯福迟迟不能理解陆军的重要性。
召回麦克亚瑟将使创建菲律宾陆军的努力中途流产，使美国陆军部、国务院和内务部高兴，并为修订橙色作战计划扫清了道路，使海军的观点占主导地位。作战计划部部长恩比克将军认为海军的观点是对的，陆军的计划应修改，以便与海军的撤退，日后伺机反攻的计划协调一致。没必要在那儿留一座兵营，被人围住，最终只得投降。
罗斯福认为自己找到了问题的解决办法，马林•克雷格却坚决反对。克雷格和麦克亚瑟曾一道在伦纳德•伍德手下工作，从那时就相互认识。他警告说，如果麦克亚瑟被召回，“总统将没有退路，因为麦克亚瑟既不会退休，也不会辞职，他将继执行现在的使命。这将使麦克亚瑟得以独行其是，陆军部将更无法控制他。”罗斯福把克雷格的警告当作耳边风。
1937年8月，麦克亚瑟回到马尼拉后不久便得到通知，他将被召回美国另作安排。克雷格告诉他不必设法改变这一决定，因为它来自最高层。
麦克亚瑟自尊心大受伤害，怒不可遏。他电传克雷格道：“你的信令我震惊。你建议的等于是解除我的职务……由于我的军阶和地位，这只能被理解为受到违纪处理……我的名声和职业声誉受到了这一处理的威胁……即使刚入伍的新兵犯错误，我军也严格按传统予以合理的处理，我几近40年忠诚不贰的效力至少应受到相同的对待吧。”
罗斯福试图平息他的愤怒，让他挑选美国境内他喜欢的任何指挥职位，还告诉他，世界局势令人十分担忧，他需要麦克亚瑟在身边，以便随时听取他的建议户奉承并不能令麦克亚瑟消气。他写信告诉克雷格：“我觉得从军队的最高职位上退下来再去位居次席令人生气。这就像让罗斯福重新去当海军部副部长。这不仅使我不满意，而且我再也无法做一个服从命令的下级指挥官。”他忘了其他的总参谋长，包括他的良师伦纳德•伍德，都在退居后接受了其他任命。他自己也曾表示，总参谋长任期到后他愿意在美国接受另一个指挥职位。这么一回忆就太令人尴尬了。这等于向公众宣布他的菲律宾使命失败了。
相反，他请求退役，但他还指出，虽然退休了，一旦战争来临，他仍然会像服役时一样随时受命。“不过我深信，”他告诉克雷格，“在我有生之年美国不会卷入战争。罗斯福总统出色的领导实际上防止了这种灾难的发生。”他坚信战争不远了，他不想断了自己的一切后路。他想战争来临时，他能重返军队，再次成为指挥人物。他对罗斯福的奉承就是为了保证这一点，克雷格肯定会把他的话转告给罗斯福的。他申请12月31日从陆军退役。
当老朋友们写信问他未来的计划时，他含含糊糊地答复说要回到他所谓的“密尔沃基老家”。该城的阿朗索•卡德沃斯美国退伍军团第23号兵站激动地授予他会员资格，希望他出席以后的聚会。他礼貌地接受了会员资格户与此同时，全军上下的朋友和崇拜者都发来热情洋溢、令人感动的颂词。他们恭喜他辉煌的成就，或表达与他相识和共事的无上荣幸。道布林迪请他的老朋友小希欧多尔•罗斯福与他联系，问他是否打算写他的回忆录。
然而，正如克雷格所预料的那样，奎松请麦克亚瑟继续留任军事顾问。他的薪水不变，继续住在马尼拉宾馆，仍然从菲律宾防务开销的每100美元中提取46美分作为酬金。就算他会进入阿朗索•卡德沃斯美国退伍军团第23号兵站的大门，那也将是很久以后的事。
