「基因組學X獎」新規則 比賽截止日延長

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【大紀元2011年11月02日訊】(大紀元記者萬君編譯報導)2006年,由梅德科提出的阿坎(Archon)「基因組學X獎」在加州普雷亞維斯塔成立,獎金為1,000萬美元,希望鼓勵經濟、準確、快速地發展用於醫療目的的人類基因組測序(sequencing)。當時的目標是在10天之內每個少於10,000美元的代價破譯100個人類基因序列。雖然八個組織最終簽署了挑戰,但是其實沒有一個企圖開始測序。

《科學雜誌》報導,從那時起測序成本直線下降,人類基因組的測序成本在10,000美元左右。但10天截止的期限仍然是一個不可能完成的挑戰。同時, 基金會和測序委員會從來沒有真正制定出如何裁決獎金。因此,他們已經決定重新開始。

今天,在《自然遺傳學期刊》的紐約市新聞發布會上,X獎基金會的楷德思和坎帕尼設計了修訂後的挑戰,其中包括不那麼緊張的截止日期和其他一些變化。

根據新的規則,100個由基金會確定的百歲老人的基因組測序比賽將於2013年1月3日發槍開始。截止日將在2月3日而不是1月13日,但贏得全獎需要每個基因組的花費不超過1,000美元。參賽作品也將必須滿足嚴格的準確性,即百萬分之一的錯誤,以及98%的完整性。

馬里蘭州洛克維爾的J. Craig Venter研究所的計算生物學家格蘭傑.薩頓說:「我認為,價格有可能實現,而且打破所有其他標準將是非常具有挑戰性的。」

如果沒有成功,只要在不同類別中的最低標準得以滿足,裁判官仍將分類頒發較小的獎項。如果超過一組滿足大獎的要求,那麼獲勝者將是第一個完成的。

楷德思表示,我們的目標是準確而又廉價地展示人類基因序列的組合是可能的,並且希望收集這些數據最終將在診所成為常規檢測。選擇超過100個健康人為科學家提供數據,主辦方也希望比賽將給長壽和健康的老齡化帶來新的見解。

他還說,組織者和他們的顧問也花了近2年的時間通過邀請來自社團輸入的方式, 發現了判斷基因組測序的省錢辦法。他們不會對已經提交的基因組進行彼此比較,而是通過比賽開始的時間,通過使用多種工藝已經完成25個基因組測序的一部分,並且用多種技術確保一個體系中每一個基準是正確的。然後,他們將提交的同糾正的序列進行比較。審計人員也將復查成本以確保每一分錢用到實處。但楷德思仍然繼續從事測序工作來選出最終的規則。

基金會將與八個原參賽者聯繫,但楷德思預測,有些人會中途離開,因為曾經專著於DNA測序的一些公司今天已經轉移了優先事項。薩頓說,原來說他們不感興趣的組織,如Illumina公司,現在可能已是強大的競爭者。鑑於比賽將舉行很久,「最有可能競爭的是那些已經調整現有技術的那些公司,」薩頓指出。話又說回來,「你永遠不能肯定將會發生什麼。」

(責任編輯:張東光)

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