【大紀元5月4日報導】（中央社記者翁翠萍台北四日電）中央研究院研究團隊在歐盟EGEE計畫協助下，針對禽流感病毒蛋白的八種可能變異結構，挑選三十萬個小分子藥物的活性反應模擬測試，在四週內使用一百三十七個CPU年的電腦計算能量加以排序後，初步分析可能有效的藥物出現在前百分之十三，篩檢成效卓著，有助尋找治禽流感藥物。
負責禽流感藥物開發的中研院基因體研究中心博士吳盈達表示，流感型式多，人類只傳染三種，鳥類常見的流感偶爾會傳給人類，近年證實H5N1可傳給人，累計近兩百人感染，其中一百三十人死亡，致死率相當高，施用克流感等藥物，又發現流感病毒蛋白會突變，中研院想從已知藥物，在實驗室設計藥物使病毒蛋白發生作用，所以需要大量計算，歐盟的EGEEE平台協助做了快速篩選，有助加速瞭解病毒突變後那些藥物仍然有效，也希望瞭解病毒蛋白在那裡變種再從中著力。
他說明，有了全球網格基礎架構（WLCG/EGEEe-Infrastructure）的超高計算能量協助，快速從三十萬個藥物結構排序找出較具信任度的近四萬個藥物結構，中研院可進一步用自己的演算法，再找出大約兩千個更可能有效的藥物結構，加速新藥開發，這第二階段找出可能藥物結構的信任度可提升為前百分之五。
這項禽流感藥物設計的計算模擬，由中研院網格計算團隊、基因體研究中心負責，與法國CorpuscularPhysics Laboratory of Clermont-Ferrand，CNRS/IN2P3、義大利Institute for BiomedicalTechnologies，CNR共同合作。由台灣與法國主導，串連EGEE、AuverGrid及中研院TWGrid三網格系統，在歐洲動員三千台電腦，使用大約一百三十七個CPU年的計算量，產生一千四百個GB（Giga Byte）的資料量。
中研院網格計算團隊主持人林誠謙博士表示，這是目前全球最大的跨國藥物設計計算合作案例。不僅證明WLCG/EGEE網格系統大幅提升了生物計算及資料分析的速度，也展現全球網格基礎架構彈性，即整合全球網格資源與即時支援大規模計算的應變能力。
他進一步說明，如果只用一台電腦，前述計算能量須要一百三十七年來完成，但現在動員兩、三千台電腦，就只需要三週半時間就可完成計算。
吳盈達則表示，如果沒有這種超高計算能量，以過去保守做法，挑選一、兩千個藥物結構，用一台電腦，至少要一兩年才可計算完成，若還找不到有效的藥物結構，又再找一兩千種可能的藥物結構繼續計算。有了全球網格基礎架構協助，才可能針對立即的疾病，廣面的取三十萬個藥物結構去計算預測，這在過去是無法想像的。
