【大紀元2012年06月08日訊】下面，讓我們再來討論一下（實證）科學的主要研究方法，即所謂的假設、解析、觀測、實驗、與邏輯推理的問題。
（一）假說。
1、「假說」本身就是一個「先驗」的東西，是一個完全主觀的產物。
2、「假說」的正確與錯誤的判斷，主要來自於實驗驗證與邏輯證明。但實驗驗證，只能局限於當下的實驗條件，它並不能對未來的結果給出「是」與「非」的確定；而邏輯證明，只是論證其「假設」在假設條件下的合理性，當「假設」超出其所設之限，邏輯證明隨之失效。
（二）解析。
這既源於「科學」的觀念，即「整體為部分之和」，又是觀測與實驗的局限性的必然。所以，「科學」講究也必須對研究物件進行解析、解剖、細分，所以它講專門性，所以它只產生專家。
可是，由「量子糾纏」現象可知，自然界中任何一個完整的系統，並不是其各個組成部分的簡單相加。要保持系統的協調有序的運行，涉及到其各個組成部分的錯綜複雜的聯繫與協調。生命系統尤其如此。所以西醫對人體的研究，就只能是在週邊打轉轉，根本觸及不到生命的實質，所以它研究的，只是生命的載體——肉體。當它專注於人的肉體進行解剖研究時，其實其時「生命」早已不存在啦。所以，西醫對人的肉體的各個局部（器官、組織）研究的再明白，對整個生命系統而言，還是摸不著邊際。不說精神現象啦，就以肉體的生命體征而言，抗生素的濫用與副作用，就是一個很好的例證。
（三）觀測。
1、科學所觀測的物件，既受限於人類的感官功能，又受限於所使用的工具的性能。即使拋開生命與精神之類的神秘現象，就以純物質世界來說，人們所能觀測的範圍，也只占人類所能認知的宇宙物質總量的4％左右，其他96%左右的既不發光也不反射光的所謂暗物質（包括暗能量），是不能被當下科學所能觀測的。
2、對於觀測物件的選擇，以及觀測的內容、方式等，完全是一種主觀的產物（主要局限於「假設」的框架之內），既不一定合理準確，更談不上全面。
3、觀測資料的精度與合理性，既受觀測工具的性能與精度及穩定性的影響，也受觀測者專業水準甚至精神狀態的影響，同時，還受觀測的方式、角度和觀測層面的影響。
4、觀測行為的本身，已經對被觀測物件產生了一定的干涉，所以，觀測的純客觀性也就成了問題。這種干涉在量子層面表現的尤為突出，因為那時的觀測者與被觀測物件已經構成了一個互動的系統，所以才會有量子力學的「測不准」原理。
（四）實驗。
1、其設計即是依據「假設」展開的，這已經就與客觀性原則發生了偏離。
2、實驗的過程是在假設的理想條件下進行的，而這種理想條件在客觀世界中並不存在，這又與客觀真實產生了偏差。
3、實驗的精度與結果，受到實驗設備水準、工具的性能與精度以及實驗人員的專業水準等因素的影響。
（五）邏輯推理。
邏輯的本質，是人對客觀事物的發展變化順序和規律的思維認知，是對真實世界的簡化與抽象。而真實世界是無限的、複雜的、相互聯繫的和有生命的，簡化的邏輯的世界卻是局限的、簡單的、機械的和無生命的。
所以，邏輯推理的問題就出現了：它用邏輯去限定客觀真實，邏輯先於真實而不是相反——真實世界先于邏輯、高於邏輯。
邏輯推理的局限性，在上面介紹的量子力學中表現的尤為明顯，以至其合理性完全消失。所以，量子力量對微粒子行為的描述，使用的是「幾率」的概念而不是「邏輯」的概念。而「量子糾纏」現象，更是完全超越了邏輯的基礎——「因果關係」。
可見，科學的研究方法，完全是在「主觀」的主導下進行的，其「客觀性」，是「主觀」限定的「客觀」，是局部的和有條件的客觀。
