【大紀元2012年06月05日訊】人類認識自然的意識路線，一直是以「信念」為基礎的。
科學的信念是：自然有內在秩序，自然界是一個完全由物質因果關係支配的封閉系統，不受任何「外來」非物質因素的干涉。
而宗教的信念是：存在一個萬能的「造物主」，即「上帝」。
這本來是兩個完全不同的意識體系，一個主要解決人的歸宿的問題，一個主要解決世俗領域的知識的問題。但由於西方文化的局限（主要是對自然與人的本質及二者關係的認識層次的局限），以及歐洲中世紀宗教對世俗生活與知識的過度干涉，導致二者在意識形態上發生激烈衝突。
結果，一方面，科學界因在其信念基礎上產生的生物進化的達爾文主義的加入，以及實用主義對科學的推崇，而最終佔據上風，「科學」也因此成為無神論者的「法寶」。
另一方面，西方宗教由於其修行方式的局限，使得其對科學的本質不能有一個透徹的瞭解；同時，由於其對世俗的不適當地干涉，使得眾多世人對其產生排斥，所以，最終不得不處於下風。
科學界在與宗教界的論戰中勝出以後，便極力維護自己的宇宙觀而排除一切與己不同的學說，並進而將「科學」推到唯一知識來源的至高地位，使人們造成「科學」與「真理」等同的錯覺，同時宣告那些被他們預先排除的學說、理論為「非科學」。既然「科學」是「真理」，那麼「非科學」當然就不是「真理」了，這樣，就使「科學」成為了另一種形式的宗教，從而壟斷了人類對知識的探索方式與對自然現象的解釋權，使科學研究成了人類認識世界的唯一途徑，只有自然現象或物質現象才具有真實性，科學不能研究的東西，就等於沒有真實性可言。
而事實是，從前文（《「科學」的「客觀性」與「科學性」，其實是一種錯覺》）的分析中我們看到，「科學」的研究，根本就不能達及「宗教」所涉及的高度與範圍，因為它既不能解釋「第一推動」的問題，又不能解釋「量子糾纏」中微觀粒子似乎有「意識」的現象之因。所以，用「科學」否定宗教中的「上帝」，實在是有些投石擊天的感覺。
此外，不同的科學理論之間，大多不能很好地銜接，甚至是互相矛盾和彼此否定的。因為它們都是建立在人的感官與經驗基礎上的（公理、公設），並借助另外的不完備的理論來構建；而研究的物件與範圍，又是自然界中的某一具體事物與某一具體領域或層面。可宇宙恰恰是一個不可分割的整體，看似不相關的事物，在冥冥之中卻存在著某種深層次的內在聯繫，更不用說生命與精神現象的種種神秘啦。所以，「科學」對宇宙、對世界的認識，不過是以管窺天，以蠡測海，至多也就是管中窺豹、盲人摸象的層次。
所以，一個人接受有神論還是無神論是一回事，而用「科學」否定「上帝」則是另一回事，二者根本就不在一個層次面上。如果硬是用近似宗教的態度對待科學，並因之以否定「上帝」，借用「科學」的話講，那是很不「科學」的。
當「科學」被推到了與其能力不相匹配的地位，並進而被實用主義者和無神論者濫用的時候，科學的種種弊端就充分地顯現出來了。
1、因為「科學」囿於人的感官感知，所以它強調看得見、摸得著，它「唯物」，它否定整體自然精神與生命神秘現象，它只注重人的生物性而排斥人的靈性，它重點滿足人的生理需求而漠視人的心靈感悟和精神修養，所以它導致拜物主義、享樂主義盛行，進而導致人精神空虛、頹廢、焦慮。
實際上，物質享受只是人類的一個基本的、初級的需求，在此基礎上，人類還有更高的精神需求，尤其當物質需求基本滿足之後，精神需求就上升到了最重要的地位，成了人生的最主要的內容，這也就是古今中外，文體明星一直受到人們追捧的原因。
可見，科學的「唯物」主義，對於正常的人生，實在是因小失大。
2、「科學」與達爾文主義及無神論糾結於一體，使人類只關心當下，不考慮歸宿，甚而自甘獸性化，從而導致個人主義、利己主義盛行，導致人與人類之間關係緊張，衝突不斷，導致人類對自然地無度索取、野蠻掠奪，導致整個社會道德下滑，生態環境急劇惡化，為了滿足個人欲望、利益，可以無所顧忌地做出任何令人髮指的行為，從而把人類導入一個加速滅亡的歧途。
3、因為「科學」講究分解剖析，講究線性邏輯，所以它對事物與世界的認識是片面的，攻其一點，不及其餘，所以它導致人的思維與行為碎片化，在不同的環境、不同的時間、針對不同的物件，其是非標準、價值判斷、行為方式完全不同，往往顧此失彼，甚至自相矛盾，它對人類與自然的價值，不是建設性的而是破壞性的，它導致事物走向解體或毀滅。
4、因為「科學」只是用特定的方式研究獨立的、靜態的所謂理想條件下的系統，所以它的結論僅在特定的範圍、條件下和層面成立，離開了這些前提，其結論就失去了意義，更談不上正確，它永遠只是實際的近似，因而必然存在誤差。而當誤差積累到一定程度，要麼偏離實際，要麼歪曲事實。而它的研究方式和結論，卻給新思想、新觀念的產生設置了一個又一個的框框，排斥了人們對客觀事物探索方式、手段以及對客觀現象解釋的多樣性。
5、由於「科學」對事物的研究和認識，總是局限於某一局部、層面和特定的物件，所以它不能建立一個圓融的自適應系統，所以它總是解決了一個問題，又同時帶來相關的其他問題，而往往帶來的問題比解決的問題更麻煩，而且時間越久，其錯謬表現得越突出，其後果越嚴重。
我們無意反對「科學」，我們樂見科學為人類帶來的種種便利。但我們反對把「科學」推到近乎宗教的不恰當的地位，並以之否定和排斥其他的認識世界的方法與途徑；我們反對把科學推及到超出它的能力和適用範圍的盲目地濫用。如果把「科學」的應用主要限於謀生的目的，並與中國傳統的「天人合一」的宇宙觀結合起來，相信「科學」為人類生活帶來更多的是「福祉」，而不是災難。
