台灣獨力完成創傷弧菌基因定序

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【大紀元12月20日訊】〔記者洪素卿╱台北報導〕由台灣衛生研究院結合陽明大學(榮陽團隊)、成功大學、工研院生醫中心所組成的基因體定序團隊,日前完成「創傷弧菌」全基因體共五百二十八萬對鹼基的定序工作,將這株每年夏天都在台灣造成多起死亡個案的致命細菌全貌揭露在國人眼前。

  參與研究的專家表示,全基因定序除了讓人類更加了解創傷弧菌的演化以及致病因素外,也有助臨床診斷與治療工作。此外,由於創傷弧菌也會感染鰻魚、蝦類等高經濟水產養殖產物,相關研究成果也可望對相關產業有所幫助。該項成果已刊載於國際知名雜誌「Genome Research(基因體研究)」。

  國衛院院長吳成文表示,這項研究成果是國內團隊首度獨力完成一個生物的完整基因體定序工作,不但是國內基因體研究的一項重大里程碑,也確立我國有能力跨足國際生醫技術領域。

  成功大學微生物免疫學研究所教授何漣漪表示,國衛院研究的這株創傷弧菌,是成大醫院十多年前從臨床病患身上培養所得的本土菌株(Yj016)。

  國衛院分子與基因醫學研究組主任蔡世峰博士表示,經過基因定序後發現,這株創傷弧菌約有五千個基因。他指出,由於創傷弧菌的鹼基重複序列很多,使得拼接基因序列的工作相對困難。因此,研究團隊雖然只花了幾個月就完成了九十九%基因定序,卻花了很多的時間「重新拼圖」,整體基因定序工作共耗時兩年。

  陽明大學生物資訊研究所助理教授張傳雄表示,目前解碼的台灣本土株創傷弧菌約有三分之二的基因,經與霍亂弧菌、腸炎弧菌基因分析比對後,已經確認相關功能基因。目前還有三分之一未知基因尚未確認功能,其中應該有不少是屬於本土創傷弧菌的特有基因。

  何漣漪表示,全基因定序就彷彿打開了一座寶庫,未來進一步發掘、研究,可望獲致更多成果。例如,創傷弧菌獨特的核酸水解酵素等,研判也具有工業應用的潛力。

創傷弧菌 致病三大弧菌之一

  創傷弧菌英文學名為Vibriovulnificus,生存於河海交界之處,又稱「海洋弧菌」。為全球重要的海洋致病細菌,與霍亂弧菌、腸炎弧菌並列為造成人類感染疾病之三大弧菌之一。在我國,每年夏天都曾造成多起死亡個案。

  一般民眾生食遭到創傷弧菌污染的海產,或是處理遭污染的魚貝類時遭刺傷等情況,都可能遭該菌感染。一般健康民眾受到創傷弧菌感染,情況不一定會很嚴重,可能有嘔吐、腹瀉、腹痛等症狀;但若是肝功能不全、肝硬化、肝癌,或是免疫力低下、糖尿病患等,創傷弧菌便容易感染並進入血液中,造成發燒、寒顫,手足部產生明顯水泡以及表皮壞死現象,以致傷口潰爛蔓延,甚至造成嚴重的敗血性休克,一旦遭到感染,致死率高達五十%。

  由於此菌感染後病變進展快速,死亡率又高,創傷弧菌之相關基礎與臨床研究已受到生物醫學界之重視。

創傷弧菌英文學名為Vibriovulnificus,生存於河海交界之處,又稱「海洋弧菌」。為全球重要的海洋致病細菌,與霍亂弧菌、腸炎弧菌並列為造成人類感染疾病之三大弧菌之一。在我國,每年夏天都曾造成多起死亡個案。

  一般民眾生食遭到創傷弧菌污染的海產,或是處理遭污染的魚貝類時遭刺傷等情況,都可能遭該菌感染。一般健康民眾受到創傷弧菌感染,情況不一定會很嚴重,可能有嘔吐、腹瀉、腹痛等症狀;但若是肝功能不全、肝硬化、肝癌,或是免疫力低下、糖尿病患等,創傷弧菌便容易感染並進入血液中,造成發燒、寒顫,手足部產生明顯水泡以及表皮壞死現象,以致傷口潰爛蔓延,甚至造成嚴重的敗血性休克,一旦遭到感染,致死率高達五十%。

  由於此菌感染後病變進展快速,死亡率又高,創傷弧菌之相關基礎與臨床研究已受到生物醫學界之重視。
(http://www.dajiyuan.com)

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