【大紀元7月20日訊】〔自由時報記者鄭琪芳／台北報導〕大法官六六一號解釋指出，偏遠路線客運業補助款課徵營業稅違憲，財政部原本曾討論適用「陳長文條款」追溯退稅的可能性，但為避免引發違憲課稅解釋的連鎖退稅效應，目前財政部已初步定調，已確定案件不能追溯退稅，未來類似案件將比照辦理。
財政部一九九七年發布解釋令，汽車及船舶客運業因行駛偏遠或服務性路線而發生虧損，所領取的政府補貼收入，應課徵營業稅；今年6月12日大法官六六一號解釋，認定財政部的函釋違憲，應不予適用。
不適用陳長文條款
由於立法院今年1月修正通過「稅捐稽徵法」，「因稅捐稽徵機關適用法令錯誤、計算錯誤或其他可歸責於政府機關之錯誤」，退稅不以五年為限，亦即所謂的「陳長文條款」，若違憲課稅解釋屬於政府錯誤，將可以追溯退稅。
知名律師陳長文因為登記在太太名下的自用住宅，被稅捐機關以營業用途課徵房屋稅長達十五年，但依法只能退還五年的稅款，陳長文因而提起行政訴訟，但是敗訴，立委因此提案修法，使得這項修法被稱為「陳長文條款」。
財部憂造成連鎖效應
財政部原本認為，違憲課稅解釋也算是「可歸責於政府機關之錯誤」，應該可以適用「陳長文條款」，過去多課的稅，都要追溯退稅。不過，此例一開，未來所有違憲課稅解釋都要比照辦理，政府隨時都可能面臨無限期退稅的壓力，對國庫衝擊難以想像，因此，財政部態度出現轉折，改為「沒有追溯退稅的問題」。
目前財政部已經初步定調，課稅解釋被宣告違憲前，仍然有法律效力，宣告違憲之後才失效，因此，已確定案件不能追溯退稅，未確定及新案件才可適用新規定。
舉例而言，大法官會議6月12日做出「偏遠地區客運業補助課徵營業稅違憲」的解釋，所以該課稅解釋應於6月12日失效，6月11日之前仍屬有效。
財政部官員表示，基於「法律安定性」考量，違憲課稅解釋不能輕易「追溯適用」，除非大法官解釋直指該課稅解釋「追溯失效」，才能適用「陳長文條款」追溯退稅。
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