SARS病毒的分子演化

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【大纪元2月23日讯】去年SARS在亚洲各地大流行后,总共夺走了约800条宝贵的生命。在去年2月的高峰期中,每天都有近50个病例诊断出。几个月后,科学家监定出SARS冠状病毒,并决定了基因组序列。之后的追踪发现SARS病毒最有可能来自果子狸,可是至今没有人知道为何它会对人类大开杀戒。

稍早的1月29日,美国出版的国际权威杂志《科学》全文公布了中国SARS病毒分子流行病学研究小组关于SARS冠状病毒分子进化规律的最新成果。[1]

该小组定序了SARS病毒的基因组序列,利用分子演化学的方法,追溯SARS病毒究竟如何从动物跳到人类身上,让整个社会人仰马翻后,并快速地适应人类这宿主。

为了找出原因,该计划为63条SARS病毒基因组定了序,他们挑出来自22个广东及2个香港SARS病人的29条分别代表SARS流行病早期、中期及晚期的病毒之序列进行分析。该研究团队利用分子演化的方法通过不同病毒基因组的比较,追溯病毒在疾病流行时的变化及其传播的关系。

该研究团队利用分子时钟来检验SARS的起源,追溯到约2002年的11月中旬,这和当初突然爆发的流行病学资料相吻合。接着他们进一步发现一个现象:SARS病毒在2002年11月中旬到2003年1月底,病毒基因的spike protein(棘蛋白,就是冠状病毒外围的那一层蛋白质套膜,这是决定它感染哪种细胞的关键)氨基酸序列变化非常快,可是从1月底到3月初,变化就慢许多。从3月初开始,SARS病毒几乎不再变化,意即之后的病人感染到的,几乎是同一个品系的病毒。

这样的现象,意味着SARS病毒从果子狸跳到人身上时,许多品系自动地进行了许多自我变异实验,以期形成一种感染人类效率最高的品系,突变完成后,感染人类效率最高的病毒就传开来了,到了2003年3月初,已经有一个品系可以完全适应人体了,这个品系不仅能在人体内生存,还能更有效地传播到他人身上。

除了棘蛋白,SARS病毒也自动删除了其原来基因组中的29个不必要的核甘酸,同时,有些品系还在它的Orf8区域自动删除了82个不必要的核甘酸。之后,在SARS流行中期的病人体内,甚至可以同时找到两种核甘酸都删除的病毒。

在2003年3月中的2个病人身上,甚至还可找到整个Orf8区域共415个核甘酸都删除的病毒。这意味着病毒在快速地演化并精简其基因组以感染人类。

同样地,1月29日在《科学》杂志上也发表一份报告说明SARS病毒至今仍难以检测,[2]这是否暗预着SARS病毒仍在快速地突变以躲避人类的追查?为着下一次的肆虐做准备?

在中国传统的中医理论认为:疾病多为外邪入侵所致。如现代西方医学认为的“流行性感冒病毒感染”就称为“风邪”。皇帝内经的《素问,上古天真论》亦有所谓“正气存内,邪不可干”之说。在当前人类无法抵抗下一波SARS病毒肆虐及发展出疫苗时,做一个堂堂正正的好人(正气存内的人)或许不失为一个根本的解决之道。@

参考资料:
1.The Chinese SARS Molecular Epidemiology Consortium, January 29,
2004; 10.1126/science.1092002 (Science Express Reports).
2.A. C. H. Yu, Science, 303, pp. 469-471, 2004(http://www.dajiyuan.com)

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