引發境外勞務糾紛的原因是多方面的，而境外僱主、外派企業或勞務人員中的一方不能遵守相關法律法規或合同約定是其中重要的原因。
主要包括：一些無資質中介和個人無視國家相關規定和法律法規，未經批准擅自組織外派勞務，甚至虛構勞務項目，收取高額費用，侵害公民合法權益；少數外派企業不遵守國家對外勞務合作管理規定，如不請我駐外使領館經商機構對項目進行確認，不到當地商務主管部門進行項目審查，不到勞務人員所在地商務主管部門進行招收備案，或不進行人員派出前的培訓或派出後的服務和管理，甚至有個別企業違規超標準收費或變相收取履約保證金等。一些境外僱主違反當地法律法規，侵害我勞務人員合法權益。
此外，也有個別勞務人員守法意識差，不遵守當地法律法規或合同規定，與境外僱主或外派企業發生分歧等。
境外勞務糾紛發生後，商務部首先會核實情況和分析原因，並按照「誰派出，誰負責」的原則，責成相關單位妥善處理。如果是外派企業的原因，由相關地方政府責成其按規定做出處理；如果是境外僱主的原因，要求外派企業在使館的指導下加強對外交涉；如果涉嫌違規違法外派，由外派企業所在地地方政府責成有關執法部門進行查處；如果是勞務人員的原因，則要求勞務人員遵守合同和法律，並做好解釋說服工作。
