然而，中立還不如麥克亞瑟創建軍隊的想法現實。這個弱小，貧窮的國家位置不佳，剛好在日本黑天神南下的路上，中立的幻想是對這一問題的逃避。日本並不想要一個菲律賓。他們覷覦的是東南亞的礦產——馬來西亞的橡膠、婆羅洲的石油、以及難以捉摸的命運之神賦予其他國家的錫、珠寶和黃金。菲律賓正好位於日本和其目標之間的航線上。
為了保障這條航線，日本陸軍必須佔領菲律賓群島。菲律賓的地理位置是它的不幸，而不是幸運。保衛群島的問題，就像解決著名的歐洲軍事難題，保衛夾在德俄之間的波蘭一樣，沒有更好的辦法。
墨菲和麥克亞瑟之間的真正區別在於，一個認為，如果日本人想要佔領菲律賓，必須讓其付出代價，而另一個眼界頗高的綏靖主義者卻不這麼認為。而對解決這一問題負有責任的總統決定召回麥克亞瑟。羅斯福大概覺得菲律賓不值得防守。他是前海軍副部長，迷信海空軍，不相信陸軍。陸軍部甚至在珍珠港事件後還發現，羅斯福遲遲不能理解陸軍的重要性。
召回麥克亞瑟將使創建菲律賓陸軍的努力中途流產，使美國陸軍部、國務院和內務部高興，並為修訂橙色作戰計畫掃清了道路，使海軍的觀點占主導地位。作戰計畫部部長恩比克將軍認為海軍的觀點是對的，陸軍的計畫應修改，以便與海軍的撤退，日後伺機反攻的計畫協調一致。沒必要在那兒留一座兵營，被人圍住，最終只得投降。
羅斯福認為自己找到了問題的解決辦法，馬林•克雷格卻堅決反對。克雷格和麥克亞瑟曾一道在倫納德•伍德手下工作，從那時就相互認識。他警告說，如果麥克亞瑟被召回，“總統將沒有退路，因為麥克亞瑟既不會退休，也不會辭職，他將繼執行現在的使命。這將使麥克亞瑟得以獨行其是，陸軍部將更無法控制他。”羅斯福把克雷格的警告當作耳邊風。
1937年8月，麥克亞瑟回到馬尼拉後不久便得到通知，他將被召回美國另作安排。克雷格告訴他不必設法改變這一決定，因為它來自最高層。
麥克亞瑟自尊心大受傷害，怒不可遏。他電傳克雷格道：“你的信令我震驚。你建議的等於是解除我的職務……由於我的軍階和地位，這只能被理解為受到違紀處理……我的名聲和職業聲譽受到了這一處理的威脅……即使剛入伍的新兵犯錯誤，我軍也嚴格按傳統予以合理的處理，我幾近40年忠誠不貳的效力至少應受到相同的對待吧。”
羅斯福試圖平息他的憤怒，讓他挑選美國境內他喜歡的任何指揮職位，還告訴他，世界局勢令人十分擔憂，他需要麥克亞瑟在身邊，以便隨時聽取他的建議戶奉承並不能令麥克亞瑟消氣。他寫信告訴克雷格：“我覺得從軍隊的最高職位上退下來再去位居次席令人生氣。這就像讓羅斯福重新去當海軍部副部長。這不僅使我不滿意，而且我再也無法做一個服從命令的下級指揮官。”他忘了其他的總參謀長，包括他的良師倫納德•伍德，都在退居後接受了其他任命。他自己也曾表示，總參謀長任期到後他願意在美國接受另一個指揮職位。這麼一回憶就太令人尷尬了。這等於向公眾宣佈他的菲律賓使命失敗了。
相反，他請求退役，但他還指出，雖然退休了，一旦戰爭來臨，他仍然會像服役時一樣隨時受命。“不過我深信，”他告訴克雷格，“在我有生之年美國不會捲入戰爭。羅斯福總統出色的領導實際上防止了這種災難的發生。”他堅信戰爭不遠了，他不想斷了自己的一切後路。他想戰爭來臨時，他能重返軍隊，再次成為指揮人物。他對羅斯福的奉承就是為了保證這一點，克雷格肯定會把他的話轉告給羅斯福的。他申請12月31日從陸軍退役。
當老朋友們寫信問他未來的計畫時，他含含糊糊地答復說要回到他所謂的“密爾沃基老家”。該城的阿朗索•卡德沃斯美國退伍軍團第23號兵站激動地授予他會員資格，希望他出席以後的聚會。他禮貌地接受了會員資格戶與此同時，全軍上下的朋友和崇拜者都發來熱情洋溢、令人感動的頌詞。他們恭喜他輝煌的成就，或表達與他相識和共事的無上榮幸。道布林迪請他的老朋友小希歐多爾•羅斯福與他聯繫，問他是否打算寫他的回憶錄。
然而，正如克雷格所預料的那樣，奎松請麥克亞瑟繼續留任軍事顧問。他的薪水不變，繼續住在馬尼拉賓館，仍然從菲律賓防務開銷的每100美元中提取46美分作為酬金。就算他會進入阿朗索•卡德沃斯美國退伍軍團第23號兵站的大門，那也將是很久以後的事。
