歷來人們認為思維是在人的大腦中進行的，而且這種思維是以語言為媒介的。最近麥吉爾大學的研究人員發現通過手勢，聾啞人也在大腦同樣部位有和能講話的人一樣的思維表現。這雖然不能說明人的元神是思維的來源，至少證明了大腦是人思維的加工廠，即人的思維可以以多種形式表現出來。
有他心通功能的人能知道操不同語言的人的心理活動。從這一點上看人的思維與語言完全是兩碼事。人的思維可以在不介入語言的狀態下進行。從另一方面來講，人們通過訓練可以使一些動物掌握一些簡單的技能。它們在做這些事情時的思維更與人的語言毫無關係。也就是說，人的大腦與思維不是一碼事。
在我看來，人的大腦與元神之間的關係就像計算機硬件與軟件之間的關係一樣。有了硬件(大腦)，而沒有軟件(元神)，這計算機就甚麼也不能做；只有裝上了軟件(元神)，這計算機才能做一些事情(就像人活起來了)。而這軟件與人的元神一樣在我們這個空間中是看不見摸不著的。
通過學習大法我們知道人真正的思維是從元神發出來的，而人的大腦只不過是一個加工廠，通過語言，手勢，把這意思表達出來。現代的實證科學雖然極其笨拙，也在點點滴滴地證實大法。
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